Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rnf144aQ925F3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rnf144aQ925F3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rnf144aQ925F3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rnf144aQ925F3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rnf144aQ925F3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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