Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Stx18Q8VDS8 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Stx18Q8VDS8 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Stx18Q8VDS8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Stx18Q8VDS8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Stx18Q8VDS8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Stx18Q8VDS8 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Stx18Q8VDS8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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Stx18Q8VDS8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Stx18Q8VDS8 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms