Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mtmr3Q8K296 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mtmr3Q8K296 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mtmr3Q8K296 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mtmr3Q8K296 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mtmr3Q8K296 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Mtmr3Q8K296 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Mtmr3Q8K296 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mtmr3Q8K296 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms