Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms