Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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