Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rdh13Q8CEE7 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rdh13Q8CEE7 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rdh13Q8CEE7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rdh13Q8CEE7 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rdh13Q8CEE7 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rdh13Q8CEE7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rdh13Q8CEE7 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms