Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nup88Q8CEC0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms