Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms