Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Nhlrc3Q8CCH2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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