Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6B2

Rtkn, Rhotekin, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtknQ8C6B2 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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RtknQ8C6B2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RtknQ8C6B2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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RtknQ8C6B2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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RtknQ8C6B2 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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RtknQ8C6B2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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RtknQ8C6B2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RtknQ8C6B2 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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RtknQ8C6B2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RtknQ8C6B2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RtknQ8C6B2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RtknQ8C6B2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RtknQ8C6B2 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RtknQ8C6B2 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RtknQ8C6B2 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RtknQ8C6B2 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RtknQ8C6B2 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RtknQ8C6B2 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RtknQ8C6B2 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RtknQ8C6B2 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RtknQ8C6B2 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RtknQ8C6B2 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms