Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm13217-201ENSMUST00000120466 953 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps113-201ENSMUST00000121318 1106 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm8143-201ENSMUST00000203654 1186 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Cutal-202ENSMUST00000047447 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Cnpy4-202ENSMUST00000110934 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms