Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c2Q8BL74 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms