Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms