Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms