Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms