Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc50Q810U5 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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