Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrfn4Q80XU8 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms