Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pcsk9Q80W65 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pcsk9Q80W65 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pcsk9Q80W65 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pcsk9Q80W65 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pcsk9Q80W65 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pcsk9Q80W65 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pcsk9Q80W65 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Pcsk9Q80W65 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Pcsk9Q80W65 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Pcsk9Q80W65 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Pcsk9Q80W65 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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