Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrc1Q80VQ1 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms