Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Dsg1bQ7TSF1 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Dsg1bQ7TSF1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Dsg1bQ7TSF1 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Dsg1bQ7TSF1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Dsg1bQ7TSF1 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Dsg1bQ7TSF1 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Dsg1bQ7TSF1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Dsg1bQ7TSF1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms