Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms