Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ccdc88cQ6VGS5 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ccdc88cQ6VGS5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ccdc88cQ6VGS5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ccdc88cQ6VGS5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ccdc88cQ6VGS5 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ccdc88cQ6VGS5 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ccdc88cQ6VGS5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ccdc88cQ6VGS5 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ccdc88cQ6VGS5 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ccdc88cQ6VGS5 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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