Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trak1Q6PD31 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms