Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Zbtb40Q6PCS8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Zbtb40Q6PCS8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Zbtb40Q6PCS8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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