Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms