Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms