Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Lama3Q61789 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
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Lama3Q61789 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Lama3Q61789 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
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Lama3Q61789 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Lama3Q61789 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lama3Q61789 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lama3Q61789 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lama3Q61789 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lama3Q61789 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lama3Q61789 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lama3Q61789 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lama3Q61789 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms