Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms