Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf123Q5XPI3 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf123Q5XPI3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf123Q5XPI3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf123Q5XPI3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf123Q5XPI3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf123Q5XPI3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf123Q5XPI3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf123Q5XPI3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf123Q5XPI3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf123Q5XPI3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf123Q5XPI3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf123Q5XPI3 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rnf123Q5XPI3 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf123Q5XPI3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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