Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTM8

Rnf20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, mousemouse

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf20Q5DTM8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf20Q5DTM8 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms