Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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