Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms