Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms