Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8521-201ENSMUST00000190394 606 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC117608.1-202ENSMUST00000224074 1049 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms