Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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