Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sec24aQ3U2P1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms