Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms