Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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