Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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