Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms