Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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