Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms