Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms