Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC166902.3-201ENSMUST00000216696 991 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Olfr170-203ENSMUST00000218837 1008 ntAPPRIS P2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm3550-201ENSMUST00000105038 1656 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tmod2-203ENSMUST00000164100 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm44792-201ENSMUST00000207008 1628 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms