Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec23aQ01405 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sec23aQ01405 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sec23aQ01405 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec23aQ01405 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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