Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms