Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Arf1P84078 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Arf1P84078 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Arf1P84078 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Arf1P84078 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Arf1P84078 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Arf1P84078 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Arf1P84078 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Arf1P84078 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Arf1P84078 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Arf1P84078 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms