Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms