Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Otx1P80205 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Otx1P80205 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms