Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcr4P70658 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcr4P70658 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcr4P70658 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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